物资和场地，全都划归武备院统一管理。
“今后，武备院就由李爱卿这位军机大臣来总管，武备院同时设置左右两个总监督，兵部侍郎毕懋康毕爱卿为左总监督，工部侍郎孙元化孙爱卿为右总监督，分别负责武备院的各种军器制造和日常具体事务。”
说完这个事情以后，皇帝又向李邦华、孙元化等人交代了武备院的有关职司和人事问题，然后端起了茶盅，喝起了参茶，众人随即告退。
第二天，内阁传出皇帝旨意，任命兵部侍郎毕懋康为军机处左参军、兵部左侍郎，专任朝廷新设的武备院左总监一职，任命工部侍郎孙元化为军机处右参军、工部右侍郎，专任武备院右总监一职。
同时还有另外几道圣旨，一个是杨应乾募民屯垦有功，升任工部侍郎，以工部侍郎衔仍任涿州新军预备大营营务总办一职；另一个是茅元仪参与筹建讲武堂有功，升任兵部侍郎，以兵部侍郎身份充任讲武堂司业。